Python实现线性判别分析(LDA)的MATLAB方式
线性判别分析(lineardiscriminantanalysis),LDA。也称为Fisher线性判别(FLD)是模式识别的经典算法。
(1)中心思想:将高维的样本投影到最佳鉴别矢量空间,来达到抽取分类信息和压缩特种空间维数的效果,投影后保证样本在新的子空间有最大的类间距离和最小的类内距离。也就是说在该空间中有最佳的可分离性。
(2)与PCA的不同点:PCA主要是从特征的协方差出发,来找到比较好的投影方式,最后需要保留的特征维数可以自己选择。但是LDA更多的是考虑了类别信息,即希望投影后不同类别之间数据点的距离更大,同一类别的数据点更紧凑。
从图中也可以看出,LDA的投影后就已经将不同的类别分开了。
所以说,LDA是以分类为基准的,考虑的是如何选择投影方向使得分类更好,是有监督的。但是PCA是一种无监督的降维方式,它只是单纯的降维,只考虑如何选择投影面才能使得降维以后的样本信息保留的最大。
(3)LDA的维度:LDA降维后是与类别个数直接相关的,而与数据本身的维度没有关系。如果有C个类别,LDA降维后一般会选择1-C-1维。对于很多二分类问题,LDA之后就剩下一维,然后再找到一个分类效果最好的阈值就可以进行分类了。
(4)投影的坐标系是否正交:
PCA的投影坐标系都是正交的,而LDA是根据类别的标注,主要关注的是分类能力,因此可以不去关注石否正交,而且一般都不正交。
(5)LDA步骤:
(a)计算各个类的样本均值:
这个地方需要注意的是,分别求出每个类别样本的Sbi或者Swi后,在计算总体的Sb和Sw时需要做加权平均,因为每个类别中的样本数目可能是不一样的。
(d)LDA作为一个分类的算法,我们希望类内的聚合度高,即类内散度矩阵小,而类间散度矩阵大。这样的分类效果才好。因此引入Fisher鉴别准则表达式:
(inv(Sw)Sb)的特征向量。且最优投影轴的个数d<=C-1;
(e)所以,只要计算出矩阵inv(Sw)Sb的最大特征值对应的特征向量,该特征向量就是投影方向W。
(6)计算各点在投影后的方向上的投影点:
MATLAB实现代码:
%这是训练数据集 %2.95006.63000 %2.53007.79000 %3.57005.65000 %3.16005.47000 %2.58004.46001 %2.16006.22001 %3.27003.52001 X=load('22.txt'); pos0=find(X(:,3)==0); pos1=find(X(:,3)==1); X1=X(pos0,1:2); X2=X(pos1,1:2); holdon plot(X1(:,1),X1(:,2),'r+','markerfacecolor',[1,0,0]); plot(X2(:,1),X2(:,2),'b*','markerfacecolor',[0,0,1]); gridon %输出样本的二维分布
M1=mean(X1); M2=mean(X2); M=mean([X1;X2]); %第二步:求类内散度矩阵 p=size(X1,1); q=size(X2,1); a=repmat(M1,4,1); S1=(X1-a)'*(X1-a); b=repmat(M2,3,1); S2=(X2-b)'*(X2-b); Sw=(p*S1+q*S2)/(p+q); %第三步:求类间散度矩阵 sb1=(M1-M)'*(M1-M); sb2=(M2-M)'*(M2-M); Sb=(p*sb1+q*sb2)/(p+q); bb=det(Sw); %第四步:求最大特征值和特征向量 [V,L]=eig(inv(Sw)*Sb); [a,b]=max(max(L)); W=V(:,b);%最大特征值所对应的特征向量 %第五步:画出投影线 k=W(2)/W(1); b=0; x=2:6; yy=k*x+b; plot(x,yy);%画出投影线
%计算第一类样本在直线上的投影点 xi=[]; fori=1:p y0=X1(i,2); x0=X1(i,1); x1=(k*(y0-b)+x0)/(k^2+1); xi=[xi;x1]; end yi=k*xi+b; XX1=[xiyi]; %计算第二类样本在直线上的投影点 xj=[]; fori=1:q y0=X2(i,2); x0=X2(i,1); x1=(k*(y0-b)+x0)/(k^2+1); xj=[xj;x1]; end yj=k*xj+b; XX2=[xjyj]; %y=W'*[X1;X2]'; plot(XX1(:,1),XX1(:,2),'r+','markerfacecolor',[1,0,0]); plot(XX2(:,1),XX2(:,2),'b*','markerfacecolor',[0,0,1]);
python实现:
importnumpyasnp importmatplotlib.pyplotasplt X=np.loadtxt("22.txt") pos0=np.where(X[:,2]==0) print(pos0) pos1=np.where(X[:,2]==1) print(pos1) X1=X[pos0,0:2] X1=X1[0,:,:] print(X1,X1.shape) X2=X[pos1,0:2] X2=X2[0,:,:] print(X2,X2.shape)
#第一步,求各个类别的均值 M1=np.mean(X1,0) M1=np.array([M1]) print(M1,M1.shape) M2=np.mean(X2,0) M2=np.array([M2]) print(M2) M=np.mean(X[:,0:2],0) M=np.array([M]) print(M) p=np.size(X1,0) print(p) q=np.size(X2,0) print(q) #第二步,求类内散度矩阵 S1=np.dot((X1-M1).transpose(),(X1-M1)) print(S1) S2=np.dot((X2-M2).transpose(),(X2-M2)) print(S2) Sw=(p*S1+q*S2)/(p+q) print(Sw) #第三步,求类间散度矩阵 Sb1=np.dot((M1-M).transpose(),(M1-M)) print(Sb1) Sb2=np.dot((M2-M).transpose(),(M2-M)) print(Sb2) Sb=(p*Sb1+q*Sb2)/(p+q) print(Sb) #判断Sw是否可逆 bb=np.linalg.det(Sw) print(bb) #第四步,求最大特征值和特征向量 [V,L]=np.linalg.eig(np.dot(np.linalg.inv(Sw),Sb)) print(V,L.shape) list1=[] a=V list1.extend(a) print(list1) b=list1.index(max(list1)) print(a[b]) W=L[:,b] print(W,W.shape) #根据求得的投影向量W画出投影线 k=W[1]/W[0] b=0; x=np.arange(2,10) yy=k*x+b plt.plot(x,yy) plt.scatter(X1[:,0],X1[:,1],marker='+',color='r',s=20) plt.scatter(X2[:,0],X2[:,1],marker='*',color='b',s=20) plt.grid() plt.show()
#计算第一类样本在直线上的投影点 xi=[] yi=[] foriinrange(0,p): y0=X1[i,1] x0=X1[i,0] x1=(k*(y0-b)+x0)/(k**2+1) y1=k*x1+b xi.append(x1) yi.append(y1) print(xi) print(yi) #计算第二类样本在直线上的投影点 xj=[] yj=[] foriinrange(0,q): y0=X2[i,1] x0=X2[i,0] x1=(k*(y0-b)+x0)/(k**2+1) y1=k*x1+b xj.append(x1) yj.append(y1) print(xj) print(yj) #画出投影后的点 plt.plot(x,yy) plt.scatter(X1[:,0],X1[:,1],marker='+',color='r',s=20) plt.scatter(X2[:,0],X2[:,1],marker='>',color='b',s=20) plt.grid() plt.plot(xi,yi,'r+') plt.plot(xj,yj,'b>') plt.show()
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