tensorflow 变长序列存储实例

2023-08-02 19:10:04 319

问题

问题是这样的，要把一个数组存到tfrecord中，然后读取

a=np.array([[0,54,91,153,177,1],
[0,50,89,147,196],
[0,38,79,157],
[0,49,89,147,177],
[0,32,73,145]])

图片我都存储了，这个不还是小意思，一顿操作

importtensorflowastf
importnumpyasnp

def_int64_feature(value):
ifnotisinstance(value,list):
value=[value]
returntf.train.Feature(int64_list=tf.train.Int64List(value=value))

#WriteanarraytoTFrecord.
#aisanarraywhichcontainslistsofvariantlength.
a=np.array([[0,54,91,153,177,1],
[0,50,89,147,196],
[0,38,79,157],
[0,49,89,147,177],
[0,32,73,145]])

writer=tf.python_io.TFRecordWriter('file')

foriinrange(a.shape[0]):
feature={'i':_int64_feature(i),
'data':_int64_feature(a[i])}

#Createanexampleprotocolbuffer
example=tf.train.Example(features=tf.train.Features(feature=feature))

#Serializetostringandwriteonthefile
writer.write(example.SerializeToString())

writer.close()


#UseDatasetAPItoreadtheTFRecordfile.
filenames=["file"]
dataset=tf.data.TFRecordDataset(filenames)
def_parse_function(example_proto):
keys_to_features={'i':tf.FixedLenFeature([],tf.int64),
'data':tf.FixedLenFeature([],tf.int64)}
parsed_features=tf.parse_single_example(example_proto,keys_to_features)
returnparsed_features['i'],parsed_features['data']

dataset=dataset.map(_parse_function)
dataset=dataset.shuffle(buffer_size=1)
dataset=dataset.repeat()
dataset=dataset.batch(1)
iterator=dataset.make_one_shot_iterator()
i,data=iterator.get_next()
withtf.Session()assess:
print(sess.run([i,data]))
print(sess.run([i,data]))
print(sess.run([i,data]))

报了奇怪的错误，Name:,Key:data,Index:0.Numberofint64values!=expected.Valuessize:6butoutputshape:[]这意思是我数据长度为6，但是读出来的是[]，这到底是哪里错了，我先把读取的代码注释掉，看看tfreocrd有没有写成功，发现写成功了，这就表明是读取的问题，我怀疑是因为每次写入的长度是变化的原因，但是又有觉得不是，因为图片的尺寸都是不同的，我还是可以读取的，百思不得其解的时候我发现存储图片的时候是img.tobytes(),我把一个数组转换成了bytes，而且用的也是bytes存储，是不是tensorflow会把这个bytes当成一个元素，虽然每个图片的size不同，但是tobytes后tensorflow都会当成一个元素，然后读取的时候再根据(height,width,channel)来解析成图片。

我来试试不存为int64，而是存为bytes。又是一顿厉害的操作

数据转为bytes

#-*-coding:utf-8-*-

importtensorflowastf
importnumpyasnp

def_byte_feature(value):
returntf.train.Feature(bytes_list=tf.train.BytesList(value=[value]))

def_int64_feature(value):
ifnotisinstance(value,list):
value=[value]
returntf.train.Feature(int64_list=tf.train.Int64List(value=value))
#WriteanarraytoTFrecord.
#aisanarraywhichcontainslistsofvariantlength.
a=np.array([[0,54,91,153,177,1],
[0,50,89,147,196],
[0,38,79,157],
[0,49,89,147,177],
[0,32,73,145]])

writer=tf.python_io.TFRecordWriter('file')

foriinrange(a.shape[0]):#i=0~4
feature={'len':_int64_feature(len(a[i])),#将无意义的i改成len，为了后面还原
'data':_byte_feature(np.array(a[i]).tobytes())}#我也不知道为什么a[i]是list（后面就知道了），要存bytes需要numpy一下

#Createanexampleprotocolbuffer
example=tf.train.Example(features=tf.train.Features(feature=feature))

#Serializetostringandwriteonthefile
writer.write(example.SerializeToString())

writer.close()

#
#UseDatasetAPItoreadtheTFRecordfile.
filenames=["file"]
dataset=tf.data.TFRecordDataset(filenames)
def_parse_function(example_proto):
keys_to_features={'len':tf.FixedLenFeature([],tf.int64),
'data':tf.FixedLenFeature([],tf.string)}#改成string
parsed_features=tf.parse_single_example(example_proto,keys_to_features)
returnparsed_features['len'],parsed_features['data']

dataset=dataset.map(_parse_function)
dataset=dataset.shuffle(buffer_size=1)
dataset=dataset.repeat()
dataset=dataset.batch(1)
iterator=dataset.make_one_shot_iterator()
i,data=iterator.get_next()
withtf.Session()assess:
print(sess.run([i,data]))
print(sess.run([i,data]))
print(sess.run([i,data]))


"""
[array([6],dtype=int64),array([b'\x00\x00\x00\x006\x00\x00\x00[\x00\x00\x00\x99\x00\x00\x00\xb1\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00'],
dtype=object)]
[array([5],dtype=int64),array([b'\x00\x00\x00\x002\x00\x00\x00Y\x00\x00\x00\x93\x00\x00\x00\xc4\x00\x00\x00'],
dtype=object)]
[array([4],dtype=int64),array([b'\x00\x00\x00\x00&\x00\x00\x00O\x00\x00\x00\x9d\x00\x00\x00'],
dtype=object)]
"""

bytes数据解码

如愿的输出来了，但是这个bytes我该如何解码呢

方法一，我们自己解析

a,b=sess.run([i,data])
c=np.frombuffer(b[0],dtype=np.int,count=a[0])

方法二使用tensorflow的解析函数

def_parse_function(example_proto):
keys_to_features={'len':tf.FixedLenFeature([],tf.int64),
'data':tf.FixedLenFeature([],tf.string)}#改成string
parsed_features=tf.parse_single_example(example_proto,keys_to_features)
dat=tf.decode_raw(parsed_features['data'],tf.int64)#用的是这个解析函数，我们使用int64的格式存储的，解析的时候也是转换为int64
returnparsed_features['len'],dat
"""
[array([6]),array([[0,54,91,153,177,1]])]
[array([5]),array([[0,50,89,147,196]])]
[array([4]),array([[0,38,79,157]])]
"""

可以看到是二维数组，这是因为我们使用的是batch输出，虽然我们的bathc_size=1，但是还是会以二维list的格式输出。我手贱再来修改点东西，

def_parse_function(example_proto):
keys_to_features={'len':tf.FixedLenFeature([1],tf.int64),
'data':tf.FixedLenFeature([1],tf.string)}
parsed_features=tf.parse_single_example(example_proto,keys_to_features)
dat=tf.decode_raw(parsed_features['data'],tf.int64)
returnparsed_features['len'],dat

"""
[array([[6]]),array([[[0,54,91,153,177,1]]])]
[array([[5]]),array([[[0,50,89,147,196]]])]
[array([[4]]),array([[[0,38,79,157]]])]
"""

呦呵，又变成3维的了，让他报个错试试

def_parse_function(example_proto):
keys_to_features={'len':tf.FixedLenFeature([2],tf.int64),#1修改为2
'data':tf.FixedLenFeature([1],tf.string)}#改成string
parsed_features=tf.parse_single_example(example_proto,keys_to_features)
returnparsed_features['len'],parsed_features['data']

"""
InvalidArgumentError:Key:len.Can'tparseserializedExample.
[[Node:ParseSingleExample/ParseSingleExample=ParseSingleExample[Tdense=[DT_STRING,DT_INT64],dense_keys=["data","len"],dense_shapes=[[1],[2]],num_sparse=0,sparse_keys=[],sparse_types=[]](arg0,ParseSingleExample/Const,ParseSingleExample/Const_1)]]
[[Node:IteratorGetNext_22=IteratorGetNext[output_shapes=[[?,2],[?,1]],output_types=[DT_INT64,DT_STRING],_device="/job:localhost/replica:0/task:0/device:CPU:0"](OneShotIterator_22)]]
"""

可以看到dense_keys=["data","len"],dense_shapes=[[1],[2]],，tf.FixedLenFeature是读取固定长度的数据，我猜测[]的意思就是读取全部数据，[1]就是读取一个数据，每个数据可能包含多个数据，形如[[1，2],[3，3，4],[2]....]，哈哈这都是我瞎猜的，做我女朋友好不好。

tensorflow变长数组存储

反正是可以读取了。但是如果是自己定义的变长数组，每次都要自己解析，这样很麻烦（我瞎遍的），所以tensorflow就定义了变长数组的解析方法tf.VarLenFeature，我们就不需要把边长数组变为bytes再解析了，又是一顿操作

importtensorflowastf
importnumpyasnp

def_int64_feature(value):
ifnotisinstance(value,list):
value=[value]
returntf.train.Feature(int64_list=tf.train.Int64List(value=value))

#WriteanarraytoTFrecord.
#aisanarraywhichcontainslistsofvariantlength.
a=np.array([[0,54,91,153,177,1],
[0,50,89,147,196],
[0,38,79,157],
[0,49,89,147,177],
[0,32,73,145]])

writer=tf.python_io.TFRecordWriter('file')

foriinrange(a.shape[0]):#i=0~4
feature={'i':_int64_feature(i),
'data':_int64_feature(a[i])}

#Createanexampleprotocolbuffer
example=tf.train.Example(features=tf.train.Features(feature=feature))

#Serializetostringandwriteonthefile
writer.write(example.SerializeToString())

writer.close()


#UseDatasetAPItoreadtheTFRecordfile.
filenames=["file"]
dataset=tf.data.TFRecordDataset(filenames)
def_parse_function(example_proto):
keys_to_features={'i':tf.FixedLenFeature([],tf.int64),
'data':tf.VarLenFeature(tf.int64)}
parsed_features=tf.parse_single_example(example_proto,keys_to_features)
returnparsed_features['i'],tf.sparse_tensor_to_dense(parsed_features['data'])

dataset=dataset.map(_parse_function)
dataset=dataset.shuffle(buffer_size=1)
dataset=dataset.repeat()
dataset=dataset.batch(1)
iterator=dataset.make_one_shot_iterator()
i,data=iterator.get_next()
withtf.Session()assess:
print(sess.run([i,data]))
print(sess.run([i,data]))
print(sess.run([i,data]))

"""
[array([0],dtype=int64),array([[0,54,91,153,177,1]],dtype=int64)]
[array([1],dtype=int64),array([[0,50,89,147,196]],dtype=int64)]
[array([2],dtype=int64),array([[0,38,79,157]],dtype=int64)]
"""

batch输出

输出还是数组，哈哈哈。再来一波操作

dataset=dataset.batch(2)
"""
Cannotbatchtensorswithdifferentshapesincomponent1.Firstelementhadshape[6]andelement1hadshape[5].
"""

这是因为一个batch中数据的shape必须是一致的，第一个元素长度为6，第二个元素长度为5，就会报错。办法就是补成一样的长度，在这之前先测试点别的

a=np.array([[0,54,91,153,177,1],
[0,50,89,147,196],
[0,38,79,157],
[0,49,89,147,177],
[0,32,73,145]])


foriinrange(a.shape[0]):
print(type(a[i]))

"""





"""

可以发现长度不一的array每一个数据是list（一开始我以为是object）。然后补齐

a=np.array([[0,54,91,153,177,1],
[0,50,89,147,196,0],
[0,38,79,157,0,0],
[0,49,89,147,177,0],
[0,32,73,145,0,0]])


foriinrange(a.shape[0]):
print(type(a[i]))

"""





"""

返回的是numpy。为什么要做这件事呢？

def_int64_feature(value):
ifnotisinstance(value,list):
value=[value]
returntf.train.Feature(int64_list=tf.train.Int64List(value=value))

tensorflow要求我们输入的是list或者直接是numpy.ndarry，如果是list中包含numpy.ndarry[numpy.ndarry]就会报错。上面的那个数组时边长的，返回的时list，没有什么错误，我们补齐看看

a=np.array([[0,54,91,153,177,1],
[0,50,89,147,196,0],
[0,38,79,157,0,0],
[0,49,89,147,177,0],
[0,32,73,145,0,0]])

"""
TypeError:onlysize-1arrayscanbeconvertedtoPythonscalars
"""

这就是因为返回的不是list，而是numpy.ndarry,而_int64_feature函数中先判断numpy.ndarry不是list，所以转成了[numpy.ndarry]就报错了。可以做些修改，一种方法是将numpy.ndarry转为list

foriinrange(a.shape[0]):#i=0~4
feature={'i':_int64_feature(i),
'data':_int64_feature(a[i].tolist())}

这样补齐了我们就可以修改batch的值了

dataset=dataset.batch(2)

"""
[array([0,2],dtype=int64),array([[0,54,91,153,177,1],
[0,38,79,157,0,0]],dtype=int64)]
[array([1,3],dtype=int64),array([[0,50,89,147,196,0],
[0,49,89,147,177,0]],dtype=int64)]
[array([4,0],dtype=int64),array([[0,32,73,145,0,0],
[0,54,91,153,177,1]],dtype=int64)]
"""

当然tensorflow不会让我自己补齐，已经提供了补齐函数padded_batch，

#-*-coding:utf-8-*-

importtensorflowastf

def_int64_feature(value):
ifnotisinstance(value,list):
value=[value]
returntf.train.Feature(int64_list=tf.train.Int64List(value=value))

a=[[0,54,91,153,177,1],
[0,50,89,147,196],
[0,38,79,157],
[0,49,89,147,177],
[0,32,73,145]]

writer=tf.python_io.TFRecordWriter('file')

forvina:#i=0~4
feature={'data':_int64_feature(v)}

#Createanexampleprotocolbuffer
example=tf.train.Example(features=tf.train.Features(feature=feature))

#Serializetostringandwriteonthefile
writer.write(example.SerializeToString())

writer.close()


#UseDatasetAPItoreadtheTFRecordfile.
filenames=["file"]
dataset=tf.data.TFRecordDataset(filenames)
def_parse_function(example_proto):
keys_to_features={'data':tf.VarLenFeature(tf.int64)}
parsed_features=tf.parse_single_example(example_proto,keys_to_features)
returntf.sparse_tensor_to_dense(parsed_features['data'])

dataset=dataset.map(_parse_function)
dataset=dataset.shuffle(buffer_size=1)
dataset=dataset.repeat()
dataset=dataset.padded_batch(2,padded_shapes=([None]))
iterator=dataset.make_one_shot_iterator()
data=iterator.get_next()
withtf.Session()assess:
print(sess.run([data]))
print(sess.run([data]))
print(sess.run([data]))


"""
[array([[0,54,91,153,177,1],
[0,50,89,147,196,0]])]
[array([[0,38,79,157,0],
[0,49,89,147,177]])]
[array([[0,32,73,145,0,0],
[0,54,91,153,177,1]])]
"""

可以看到的确是自动补齐了。

图片batch

直接来测试一下图片数据

#-*-coding:utf-8-*-

importtensorflowastf
importmatplotlib.pyplotasplt
def_byte_feature(value):
returntf.train.Feature(bytes_list=tf.train.BytesList(value=[value]))

files=tf.gfile.Glob('*.jpeg')
writer=tf.python_io.TFRecordWriter('file')
forfileinfiles:

withtf.gfile.FastGFile(file,'rb')asf:
img_buff=f.read()
feature={'img':_byte_feature(tf.compat.as_bytes(img_buff))}
example=tf.train.Example(features=tf.train.Features(feature=feature))
writer.write(example.SerializeToString())
writer.close()


filenames=["file"]
dataset=tf.data.TFRecordDataset(filenames)
def_parse_function(example_proto):
keys_to_features={'img':tf.FixedLenFeature([],tf.string)}
parsed_features=tf.parse_single_example(example_proto,keys_to_features)
image=tf.image.decode_jpeg(parsed_features['img'])
returnimage

dataset=dataset.map(_parse_function)
dataset=dataset.shuffle(buffer_size=1)
dataset=dataset.repeat()
dataset=dataset.batch(2)
iterator=dataset.make_one_shot_iterator()
image=iterator.get_next()

withtf.Session()assess:
img=sess.run([image])
print(len(img))
print(img[0].shape)
plt.imshow(img[0][0])

"""
Cannotbatchtensorswithdifferentshapesincomponent0.Firstelementhadshape[440,440,3]andelement1hadshape[415,438,3].
"""

看到了没有，一个batch中图片的尺寸不同，就不可以batch了，我们必须要将一个batch的图片resize成相同的代大小。

def_parse_function(example_proto):
keys_to_features={'img':tf.FixedLenFeature([],tf.string)}
parsed_features=tf.parse_single_example(example_proto,keys_to_features)
image=tf.image.decode_jpeg(parsed_features['img'])
image=tf.image.convert_image_dtype(image,tf.float32)#直接resize，会将uint8转为float类型，但是plt.imshow只能显示uint8或者0-1之间float类型，这个函数就是将uint8转为0-1之间的float类型，相当于除以255.0
image=tf.image.resize_images(image,(224,224))
returnimage

但是有时候我们希望输入图片尺寸是不一样的，不需要reize，这样只能将batch_size=1。一个batch中的图片shape必须是一样的，我们可以这样折中训练，使用tensorflow提供的动态填充接口，将一个batch中的图片填充为相同的shape。

dataset=dataset.padded_batch(2,padded_shapes=([None,None,3]))

如果我们想要将图片的名称作为标签保存下来要怎么做呢？

#-*-coding:utf-8-*-

importtensorflowastf
importmatplotlib.pyplotasplt
importos

out_charset="ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZabcdefghijklmnopqrstuvwxyz0123456789"

def_byte_feature(value):
returntf.train.Feature(bytes_list=tf.train.BytesList(value=[value]))

def_int64_feature(values):
ifnotisinstance(values,list):
values=[values]
returntf.train.Feature(int64_list=tf.train.Int64List(value=values))

files=tf.gfile.Glob('*.jpg')
writer=tf.python_io.TFRecordWriter('file')
forfileinfiles:
withtf.gfile.FastGFile(file,'rb')asf:
img_buff=f.read()
filename=os.path.basename(file).split('.')[0]
label=list(map(lambdax:out_charset.index(x),filename))
feature={'label':_int64_feature(label),
'filename':_byte_feature(tf.compat.as_bytes(filename)),
'img':_byte_feature(tf.compat.as_bytes(img_buff))}
example=tf.train.Example(features=tf.train.Features(feature=feature))
writer.write(example.SerializeToString())
writer.close()


filenames=["file"]
dataset=tf.data.TFRecordDataset(filenames)
def_parse_function(example_proto):
keys_to_features={
'label':tf.VarLenFeature(tf.int64),
'filename':tf.FixedLenFeature([],tf.string),
'img':tf.FixedLenFeature([],tf.string)}
parsed_features=tf.parse_single_example(example_proto,keys_to_features)
label=tf.sparse_tensor_to_dense(parsed_features['label'])
filename=parsed_features['filename']
image=tf.image.decode_jpeg(parsed_features['img'])
returnimage,label,filename

dataset=dataset.map(_parse_function)
dataset=dataset.shuffle(buffer_size=1)
dataset=dataset.repeat()
dataset=dataset.padded_batch(3,padded_shapes=([None,None,3],[None],[]))
#因为返回有三个，所以每一个都要有padded_shapes,但是解码后的image和label都是变长的
#所以需要padNone,而filename没有解码，返回来是byte类型的，只有一个值，所以不需要pad
iterator=dataset.make_one_shot_iterator()
image,label,filename=iterator.get_next()

withtf.Session()assess:
print(label.eval())

瞎试

如果写入的数据是一个list会是怎样呢

a=np.arange(16).reshape(2,4,2)

"""
TypeError:[0,1]hastypelist,butexpectedoneof:int,long
"""

不过想想也是，tf.train.Feature(int64_list=tf.train.Int64List(value=value))这个函数就是存储数据类型为int64的list的。但是如果我们要存储词向量该怎么办呢？例如一句话是一个样本s1='我爱你',假如使用one-hot编码，我=[0,0,1],爱=[0,1,0],你=[1,0,0],s1=[[0,0,1],[0,1,0],[1,0,0]]。这一个样本该怎么存储呢？

以上这篇tensorflow变长序列存储实例就是小编分享给大家的全部内容了，希望能给大家一个参考，也希望大家多多支持毛票票。

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tensorflow 变长序列存储实例

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