基于TensorBoard中graph模块图结构分析
在上一篇文章中,我们介绍了如何使用源码对TensorBoard进行编译教程,没有定制需求的可以直接使用pip进行安装。
TensorBoard中的graph是一种计算图,里面的点用于表示Tensor本身或者运算符,图中的边则代表Tensor的流动或者控制关系。
本文主要从代码的层面,分析graph的数据来源与结构。
一般来说,我们在启动TensorBoard的时候会使用--logdir参数配置文件路径(或者设置数据库位置),这些日志文件为TensorBoard提供了数据。于是我们打开一个日志文件,查看里面的内容
我们看到,文件是通过二进制展示的,因此无法直接读取文件的内容。
回到浏览器中,进入graph页面,通过开发者工具发现,构造图的时候调用了一个接口
http://localhost:6006/data/plugin/graphs/graph?large_attrs_key=_too_large_attrs&limit_attr_size=1024&run=task1
用浏览器打开这个地址,看到以下内容
node{ name:"Input/X" op:"Placeholder" attr{ key:"_output_shapes" value{ list{ shape{ unknown_rank:true } } } } attr{ key:"dtype" value{ type:DT_FLOAT } } attr{ key:"shape" value{ shape{ unknown_rank:true } } } } ...
每个node都能够与图中的一个节点相对应,因此我们可以确定,这个接口里返回的node,就是构成图所需要的数据结构。
那么,TensorBoard是如何将日志文件转化为图的呢?
TesnorBoard中的每个模块都是以plugin存在的,我们进入tensorboard/plugin/graph/graphs_plungin.py,在这个文件中定义了graph相关的接口
defget_plugin_apps(self): return{ '/graph':self.graph_route, '/runs':self.runs_route, '/run_metadata':self.run_metadata_route, '/run_metadata_tags':self.run_metadata_tags_route, }
我们可以看到,‘/graph'这个接口返回值为self.graph_route,在这个文件中搜索graph_route方法
@wrappers.Request.application defgraph_route(self,request): """Givenasinglerun,returnthegraphdefinitioninprotobufformat.""" run=request.args.get('run') ifrunisNone: returnhttp_util.Respond( request,'queryparameter"run"isrequired','text/plain',400) limit_attr_size=request.args.get('limit_attr_size',None) iflimit_attr_sizeisnotNone: try: limit_attr_size=int(limit_attr_size) exceptValueError: returnhttp_util.Respond( request,'queryparameter`limit_attr_size`mustbeaninteger', 'text/plain',400) large_attrs_key=request.args.get('large_attrs_key',None) try: result=self.graph_impl(run,limit_attr_size,large_attrs_key) exceptValueErrorase: returnhttp_util.Respond(request,e.message,'text/plain',code=400) else: ifresultisnotNone: (body,mime_type)=result#pylint:disable=unpacking-non-sequence returnhttp_util.Respond(request,body,mime_type) else: returnhttp_util.Respond(request,'404NotFound','text/plain', code=404)
在这个方法中,分别取了“run”,”limit_attr_size“和“large_attrs_key”三个参数,和前面url所调用的参数一致,说明这个是我们要找的方法。在方法的最后,调用了self.graph_impl生成了图,我们继续查看这个方法
defgraph_impl(self,run,limit_attr_size=None,large_attrs_key=None): """Resultoftheform`(body,mime_type)`,or`None`ifnographexists.""" try: graph=self._multiplexer.Graph(run) exceptValueError: returnNone #ThisnextlinemightraiseaValueErrorifthelimitparameters #areinvalid(sizeisnegative,sizepresentbutkeyabsent,etc.). process_graph.prepare_graph_for_ui(graph,limit_attr_size,large_attrs_key) return(str(graph),'text/x-protobuf')#pbtxt
这个方法调用了self._multiplexer.Graph(run)生成图。_multiplexer是一个event_multiplexer实例,在graph_plugln初始化时通过base_plaugin.TBContext获得。
def__init__(self,context): """InstantiatesGraphsPluginviaTensorBoardcore. Args: context:Abase_plugin.TBContextinstance. """ self._multiplexer=context.multiplexer
进入tensorboard/backend/event_processing/event_multiplexer,找到Graph方法
defGraph(self,run): """Retrievethegraphassociatedwiththeprovidedrun. Args: run:Astringnameofaruntoloadthegraphfor. Raises: KeyError:Iftherunisnotfound. ValueError:Iftherundoesnothaveanassociatedgraph. Returns: The`GraphDef`protobufdatastructure. """ accumulator=self.GetAccumulator(run) returnaccumulator.Graph() defGetAccumulator(self,run): """ReturnsEventAccumulatorforagivenrun. Args: run:Stringnameofrun. Returns: AnEventAccumulatorobject. Raises: KeyError:Ifrundoesnotexist. """ withself._accumulators_mutex: returnself._accumulators[run]
Graph方法获取了run对应的accumulator实例,并返回了这个实例的Graph方法的返回值。我们进入tensorboard/backend/event_processing/event_accumulator,找到Graph()方法
defGraph(self): """Returnthegraphdefinition,ifthereisone. Ifthegraphisstoreddirectly,returnthat.Ifnographisstored directlybutametagraphisstoredcontainingagraph,returnthat. Raises: ValueError:Ifthereisnographforthisrun. Returns: The`graph_def`proto. """ graph=tf.GraphDef() ifself._graphisnotNone: graph.ParseFromString(self._graph) returngraph raiseValueError('ThereisnographinthisEventAccumulator')
事实上,它返回了一个GraphDef图,因此我们也可以通过将日志转换为GraphDef的方式读取日志。
#导入要用到的基本模块。为了在python2、python3中可以使用E侣兼容的print函数 from__future__importprint_function importnumpyasnp importtensorflowastf #创建图和Session graph=tf.Graph() sess=tf.InteractiveSession(graph=graph) #日志路径 model_fn='/log/events.out.tfevents.1535957014.ubuntu' foreintf.train.summary_iterator(model_fn): ife.HasField('graph_def'): graph=e.graph_def; graph_def=tf.GraphDef() graph_def.ParseFromString(graph) print(graph_def)
我们新建一个python文件,修改日志路径为自己的日志位置,便可以得到与TensorBoard相同的内容。
以上这篇基于TensorBoard中graph模块图结构分析就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持毛票票。
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