Python 存取npy格式数据实例
数据处理的时候主要通过两个函数
(1):np.save(“test.npy”,数据结构)----存数据
(2):data=np.load('test.npy")----取数据
给2个例子如下(存列表)
1、
z=[[[1,2,3],['w']],[[1,2,3],['w']]] np.save('test.npy',z) x=np.load('test.npy') x: ->array([[list([1,2,3]),list(['w'])], [list([1,2,3]),list(['w'])]],dtype=object)
2、存字典
x ->{0:'wpy',1:'scg'} np.save('test.npy',x) x=np.load('test.npy') x ->array({0:'wpy',1:'scg'},dtype=object)
3、在存为字典格式读取后,需要先调用如下语句
data.item()
将数据numpy.ndarray对象转换为dict
补充知识:python读取mat或npy文件以及将mat文件保存为npy文件(或npy保存为mat)的方法
读取mat文件并存为npy格式文件
具体见代码,注意h5py的转置问题
importnumpyasnp fromscipyimportio mat=io.loadmat('yourfile.mat') #如果报错:PleaseuseHDFreaderformatlabv7.3files #改为下一种方式读取 importh5py mat=h5py.File('yourfile.mat') #mat文件里可能有多个cell,各对应着一个dataset #可以用keys方法查看cell的名字,现在要用list(mat.keys()), #另外,读取要用data=mat.get('名字'),然后可以再用Numpy转为array print(mat.keys()) #可以用values方法查看各个cell的信息 print(mat.values()) #可以用shape查看维度信息 print(mat['your_dataset_name'].shape) #注意,这里看到的shape信息与你在matlab打开的不同 #这里的矩阵是matlab打开时矩阵的转置 #所以,我们需要将它转置回来 mat_t=np.transpose(mat['your_dataset_name']) #mat_t是numpy.ndarray格式 #再将其存为npy格式文件 np.save('yourfile.npy',mat_t)
npy文件的读取很简单
importnumpyasnp
matrix=np.load('yourfile.npy')
可以重新读取npy文件保存为mat文件
方法一(在MATLAB双击打开时遇到了错误:UnabletoreadMAT-file*********.mat.NotabinaryMAT-file.Tryload-ASCIItoreadastext.):
importnumpyasnp matrix=np.load('yourfile.npy') f=h5py.File('yourfile.mat','w') f.create_dataset('dataname',data=matrix) #这里不会将数据转置
方法二(使用scipy):
fromscipyimportio mat=np.load('rlt_gene_features.npy-layer-3-train.npy') io.savemat('gene_features.mat',{'gene_features':mat})
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