通过python读取txt文件和绘制柱形图的实现代码
目的
临床数据的记录时间和对应标签(逗号后面的数字)记录在txt文件里,要把标签转换为3类标签,并且计算出每个标签的分别持续时间,然后绘制成柱形图方便查阅。
小难点分析:
(1)txt的切割读取对应内容
(2)时间差计算
使用效果
首先将原始txt转换为 左列新标签右列持续时间
绘制为柱形图
为了直观,每次只最多显示2个小时,同时横坐标还是按照临床的记录时间顺序。
代码实现
#-*-coding:utf-8-*- fromdatetimeimportdatetime importmatplotlib.pyplotasplt frommatplotlib.font_managerimportFontProperties font_set=FontProperties(fname=r"c:\windows\fonts\simsun.ttc",size=12) address="D:/XXXXXX/" patient="XXXXX" year='2020'#or2020 txt_address=address+patient+"/timetable.txt" filename=address+patient+"/newTimeTable.txt"#保存的txt地址 #读取txt的相应内容 defshowLabel(): content=[] label=[] rawtime=[] withopen(txt_address,'r',encoding="utf-8")asf: lines=f.readlines()#返回的是列表 print("文件的行数:%d"%len(lines)) forlineinlines: content_value=line.split(sep=',')#分为[0]和[1] time_value=content_value[0].split(sep=year) content_value=content_value[1].split(sep='\n') temp_time=year+time_value[-1] rawtime.append(temp_time) content.append(content_value[0]) #去掉第一行的line和转换label foriinrange(1,len(lines)):#range是左闭右开 number=int(content[i]) ifnumber==4: label_value=1#label1表示癫痫发作 elifnumber==1: label_value=0#label0表示数据缺失 else: label_value=-1#label-1表示非癫痫发作 label.append(label_value) delrawtime[0]#去掉第一行的line length=len(lines) returnlabel,rawtime,length #计算时间差 defgetTimeSpan(new_label,time,length): time_span=[] time_label=[] temp=datetime.strptime(time[0],"%Y-%m-%d%H:%M:%S") foriinrange(0,length-2): ifnew_label[i]!=new_label[i+1]: end_time=datetime.strptime(time[i+1],"%Y-%m-%d%H:%M:%S") diff=end_time-temp temp=end_time #time_span.append(diff)标准化时间 time_span.append(round(diff.total_seconds()/60,2))#保留两位小数 time_label.append(new_label[i]) returntime_span,time_label #画图,按照标签内容给图上色 defshowTimeandLabel(time_span,time_label): Yanse=[] foriintime_label: ifi==0: yanse='blue' elifi==-1: yanse='gray' else: yanse='red' Yanse.append(yanse) plt.bar(range(len(time_span)),time_span,width=0.8,tick_label=time_label,color=Yanse) plt.xlabel('标签',fontproperties=font_set) plt.ylabel("持续时间(分钟)",fontproperties=font_set) plt.title("patient:"+patient,size=20) plt.ylim(0,120) plt.show() #保存到txt deftxtSave(time_span,time_label): #w:向文件中写入内容时,会先清空原文件中的内容, withopen(filename,'w',encoding="utf-8")asf: line_number=len(time_label) foriinrange(line_number): f.write(str(time_label[i])+""+str(time_span[i])) f.write("\n") defmain(): new_label,time,length=showLabel() time_span,time_label=getTimeSpan(new_label,time,length) txtSave(time_span,time_label) showTimeandLabel(time_span,time_label) if__name__=='__main__': main()
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